पुनः संयोजक डीएनए प्रौद्योगिकी में, प्रतिबंध एंजाइमों द्वारा डीएनए को काटने के बाद उत्पन्न डीएनए के टुकड़ों को जेल वैद्युतकणसंचलन द्वारा उनके आकार या लंबाई के अनुसार अलग किया जाता है। जेल वैद्युतकणसंचलन एक जेल मैट्रिक्स में किया जाता है ताकि समान विद्युत आवेशों के अणुओं को आकार के आधार पर अलग किया जा सके। जेल वैद्युतकणसंचलन में सबसे अधिक इस्तेमाल किया जाने वाला मैट्रिक्स agarose है। विद्युत क्षेत्र के प्रभाव में टुकड़े अलग हो जाते हैं। अलग किए गए डीएनए टुकड़े को एथिडियम ब्रोमाइड (ईटीबीआर) नामक यौगिक के साथ डीएनए को धुंधला करने के बाद ही उज्ज्वल नारंगी बैंड के रूप में यूवी विकिरण के संपर्क में आने के बाद देखा जा सकता है। 2. वह कारक जो जेल वैद्युतकणसंचलन में डीएनए प्रवासन की दर को प्रभावित नहीं करेगा